Cohesion Group 38 Alignment

» Cohesion Group 38 Alignment

Wend_a_\|_CG-38					`MDKIIIKKFGGTSLTD---LNRVANLIKNDIEKGCNVIVVVSAVAGFTDQMVFQARQI-SNLSYRQELSEYDVMLSAGEQISCGLLAITLQSIGVNAKSWLAWQLPIVTDDFYSESKIKTIKIERVKRSFAEGYTAAIIAGFQGIN-DDRITTFGRGGSDISAVAFAVAFGVRTCEIFTDIDGIYTADPRIVPKARKLKFISYDEMLEMSSSGAKILHNRSVQLAMKHNIKVQVLSTFKEVEGTTVLHKRDV------------------------------------------------LERYLITGITYSTNEALVTFTNLA---NNLRTLRDIAGANVKIDMIHGSS---------FVISKFDIDLMEKLLNKNEN------YAINDNVAKISIIGIGVMSNTEVMHRTLKVLSEKKIEILAITTSEIKISIIVQKECAVALVKDLHTEYELDMQH`
Amar_Aa_\|_CG-38					`MGRILVKKFGGTSLKDVECILRVANIVRQSVERGHKLVVVVSAMGRFTDEAVTTAQEV-SELASEAQLSEYDVVVSSGEQVSCGLLALALQRIDIKATSIMGWQIPINTTGEHSRARIIEIKPDRILSLLNEH-DVVIVAGFQGIH-NARITTLGRGGSDISAVAIAAALRLDACYMYTDVAGVYTANPCLVPSARKLDHVTYNDMVEISASGRAILNVRSVEMAMRCGVRIHVMSSSQEAKGTLVSFGCER-----------------------------------------------EMESRIITGIAISKKIASVSLGGVPAVPGIAAALLPIAEGNIDVDMIMQTVDGELRN-ITFTVQEEDLQKTQDILLQHKHNILYESLAVTDSLAKVSLVGACMISRPGVASRVFSALASGGIAVLAVSTSEIKITVLMHEQSAAPALSLLHEEFALDR-ESVLCT`
Ecan_Aa_\|_CG-38					`MERILVKKFGGTSLQDIKCINKVVEIIKQDINNNYKVVVIVSAMGKFTDNIISQIKQI-SDVKSPSERSEYDLIISSGEQISCGLLSLALQKVGINAQSWLGWQLPIVTTEDHTKARIIDINVNSLQDSLANN-DVAIVAGFQGMHKNNRVTTLGRGGSDTSAVAIAVALGVDLCYIYTDVDGIYTADPNLVPKAHKLDYITYDEMIEMSSLGAKVLQVRSVEIAMKYNIKLCILSTFNPGKGTMLCKKGES-----------------------------------------------HMESQLITGVTCNNKTASITLKQVKTLSGITTVFNAIAEKNINVDMIIQNMNDNNANDITFTISEEDLPTTKKFLTEIQSELMYQDLIINSEVAKVSIIGVGMISHSGIAYKMFDTLTSNNIKILAVTTSEIKISVLIYRKDSQLATVALHSAFELDSTESNLYTIS`
Echa_Aa_\|_CG-38					`MKRILVKKFGGTSLQDIECINRVAEIIKQDVNNNYKVVVVVSAMGKFTDNIISQIKQI-SDVKSQSERSEYDLIISSGEQISCGLLSLALQKIGINAQSWLGWQLPIVTTEDHTKARIIDINTCSLQDSLANN-DVAIVAGFQGMHKNNRVTTLGRGGSDTSAVAIAAALKVDLCYIYTDVDGIYTADPNVVPKARKLDYITYDEMIEMSSLGAKVLQVRSVEIAMKYNIKLCILSTFNPGKGTILRKKGES-----------------------------------------------DMESQLITGVTCNNKTASITLKEVKAISGVTTVFNAIAEKNINVDMIIQSVNDNNANDITFTISEEDLPTTTKFLTEIQTELMYQDLIINSEVAKVSIIGVGMISHSGVAYKMFDTLTSNNIKILAVTTSEIKISVLISRKDSQLATIALHSTFGLDNTESDLHIIS`
Erum_Aa_\|_CG-38					`MTKILVKKFGGTSLQNIKCINQVTEIIKQDVCSNHKVVVIVSAMGKFTDNIISQIKKI-SDVKSYNELSEYDLIISSGEQISCGMLSLALQKLGIKAQSWLGWQLPIVTTDDHTKARIMEINTSALQDFLANN-DVAIIAGFQGMHKENRVTTLGRGGSDTSAVAIAAALGIDLCYIYTDVDGIYTSDPNIVPKARKLDYIAYDEMIEMASLGAKVLQVRSVELAMKYNIKLHVLSTFNSIKGTILCKKGEI-----------------------------------------------KMESQLITGITYNSNTASITLKKVRALFGITTLFSIIADNGINVDMIIQNMDNNAND-ITFTIPEEDLSITETLLIKTKDKLMYEELIINPDVAKVSVIGVGMISHPGIAYKMFDTLTSNNITILAVTTSEIKISVLVLRKDGQLATQYLHSSFKLDS-QSNLHTTS`
Otsu_Aa_\|_CG-38					`MN-IIVQKFGGACVSDTAKIANLVTKVQREIDASNKVIVVVSAMAGITKKLISFCYNLNSELYTPETLAEYDSALSSGEIMTASLFALALQQKSIKSRSLHSWQIPIKTNNYHSKAIIIDINTNLIHDMLLQG-IVPVISGFQGITNHNRITTLGRGGSDITAVAIAAALQAKRCDIYTTVDGVFSADPELIPQACKHDKITYTEMLELASLGSRVVHYRAVQMGMRYNVPIKVIHAFGKGQGTIIQEIT-------------------------------------------------TMEQPQITGITYNKDIILVTI-CINDNKQFFLVINHMLKYSVSIEQITNYQLNKVS----IIIPLSDLTASKKAFDELQNQCIINSYQIN-NVASVSVVGYAIKYNPSIFQQITMVLSKFEVQILGILALEARISIILNKIDVEPIVAELHHHLISTASSAI`
Rbel_Aa_\|_CG-38					`MA-LIIQKFGGTSVTTIDRIKKIIPIIKAEIAKNNQVIIVVSAMAGVTNQLVTLCNEV-SSLNKSSQLAEYDVALSSGEIVTASLLALALQEENINARSFLAWQLPILTDDNHSKALVESVDTNLLNECLQQN-IIPIIAGFQGINKHNRLATLGRGGSDTTAALIAAAMKADRCDIYTDVEGVFAADPRIIPKAKKIDEIDFSEMLELALSGAKVLHSRAAEIVMRYQIDMRILSTFAPEAGCTLITSKDK-----------------------------------------------IMEKRIISGITSNKNLLYITIESSS--LNFIQVASIIAQNNNHIEVMQEIEPNKRYS---FITNLTDKNSLHILLTNLKNNNQISNFTFDTEIATVSIIGHGIKNDLKLLEVILSKLAKDNINVQMVQISEIKIILLINDKQVEKTVLDLYDLLKISETGHC`
Rcon_Aa_\|_CG-38					`MA-LIIQKFGGTSVANIDRIKKIVPIIKTEIAKNNQVIVVVSAMAGVTNQLVTLCNEL-SSLNNISQFAEYDVALSSGEIVTASLLALALQEEDIKARSFLAWQLPMLTDNNHSKALVESITTDLLEKYLQLN-TIPIIAGFQGINKSNRLTTLGRGGSDTTAALIAAAMKADRCDIYTDVEGIFTADPRIIPNAKKIKEIDFLEMLELASSGAQVLHPRAGELVMRYKIDMRVLSTFSPDTEGTLITSKDK-----------------------------------------------NMENGIINSITSNKNLLKISVKSMS--LSFLQVANMITQNNNHIEFMQEIKNNEEYS---FITNLTDKNNLQALLTNLKDDKQIQYFTFDTEIATISLIGYGIKNDCKLLETILSKLTNDNINVHMIQLSEVKITLFINDQDTEKTIFNLYNLFKIS`
Rfel_Aa_\|_CG-38					`MA-LIIQKFGGTSVANIDRIKKIAPIIKAEIAKNNQVIVVVSAMAGVTNQLVTLCNEV-SSLNNISQFAEYDVALSSGEIVTASLLALALQEEDIKAQSFLAWQLPILTDNNHSKALVESITTDLLEKYLQLN-TVPIIAGFQGTNKSNRLTTLGRGGSDTTAALIAAAMKAKRCDIYTDVEGIFTADPRIIPNAKKIKEIDFLEMLELASSGAKVLHPRAVELVMRYKIDMRVLSTFSPNTEGTLITSKDK-----------------------------------------------NMENGIINSITSNKNLLKISVKSIS--LSFLQVANMITQNNNHIEFMQEIKNNEEYS---FITNLTDENNLQALLTNLKNDKQIQDFTFDAEIATISLIGYGIKNDCKVLEMILSKLTKDNINVNMIQLSEVKITLLINDQDAEKTIFNLYNLFKIS`
Rpro_Aa_\|_CG-38					`MA-LIIQKFGGTSVANVERIKKLVPIIKAEIAKNNQVIVVVSAMAGVTNQLVTLCNEV-SSLNKRSQFAEYDVALSSGEIVTASLLALALQEEEIKAQSLLAWQLPIRTNNNYSKALVEFITTDLLEKYLQLK-IIPIIAGFQGINKSNRVTTLGRGGSDTTAALIAAAMKADRCDIYTDVDGIFTADPRIIPNAKRIKEIDFLEMLELASSGAKVLHPRAVELVMRYKIDMRVLSTFSPNTEGTLITSKDTIPLVKSTY--MEESALNTKHSTKIDIPEDASGSTYKLPIELALQNRYNMENCVVRCITSNKNLLKVSVNSIS--LSFLQVANMITYNNNCIEFMQEIENNIEYN---FITNLTDKNNLQTLLTKCKNNKQIQDFTFDTEIATISLIGYGIKNDCKLLTMILSQLTQDNINVHMMQLSEVKITLLINDKDVEKTIFNLYNLFKIS`
Rtyp_Aa_\|_CG-38					`MA-LIIQKFGGTSVANIERIKKLVPIIKAEITKNNQVIVVVSAMAGVTNQLVTLCSEV-SSLNKISQFAEYDVALSSGEIVTAALLALALQEEEIQAQSLLAWQLPILTNNNHSKALVEFITTDLLEKCLQLK-IIPIIAGFQGINKSNRITTFGRGGSDTTAALIAAAMKADRCDIYTDVDGIFTADPRIIPNAKRIKEIDFLEMLELASSGAKVLHPRAVELVMRYKIDMRVLSTFLPNTEGTLITSKDTTPLVKSTYMDMEESAKNIKRSTKINIPDDTSGLTYKLPIELALQNRYNMENCIIRGITSNKNLLKVSVNTIT--LSFLQVANMITYNNNCIEFMQEIKNNIEYN---FITNLTDKNNLQTLLTNCKNNKQIQNFTFDTEIATISLIGYGIKNDCKLLEMILSQLTQDNINVNMMQLSEVKITLLINDKDVEKTISNLYNLFKIS`
Consen1		Primary consensus			M iiiqKFGGTSv d I kv iik ei nnqViVvVSAMagfTd lvt ev-S l q aEYDv lSSGEivtasLLaLALQe IkAqS laWQlPI T n hskA i I l L - vpIiAGFQGinksnRiTTlGRGGSDttAvaIAaAm d CdIYTDVdGiftADP iiP A kid I y EMlElassGakvLh Ra elaMry i m vlStF gt l d -------------- - - ---- -- - -- -------------- ME iI giT n n a itv v Ia n ie i ---Fit l D L kn i fn evAtvSliG iksd v il Lt I v av SEiKIslli k Lh f is s LhTIS
Consen2		Secondary consensus			llvk l n v dv g k v i gkv n is v e s l i qiscg s n g i yt v i ia v mh- f is al v l k y e vy lv rlk f i ms l i q s q v k v i eg v e plvksty meesa n k stki ip d sg tyklpielalqnry sv s k l vs t vd m dit ti e q y id i ki v min f i m v t i y l ld

Consensus 1 (when a gap)

Conservative difference

Consensus 2 (when a gap)

Nonconservative diff.

Other character